黄进课题组ChatGPT
黄进课题组ChatGPT辅助工具使用文档
地址：http://8.130.86.52:8080/
账号：HJlab
密码：EM6085xc3
功能解释
谷歌学术检索总结
更新至 3.36 版本，成功配置了谷歌学术检索功能，可以批量获取文献的题目、作者、被引数量和中文摘要
打开下列任意一个谷歌学术镜像，搜索文献，复制搜索链接地址
注：这里可以使用任意谷歌学术镜像，可以自己寻找，但必须允许爬虫，这样 ChatGPT 才可以爬取关键信息
粘贴到 ChatGPT 的输入框中，在插件列表选择“谷歌学术检索助手”插件，点击插件按钮即可得到结果，出结果的时间较长请耐心等待
结果会输出两份报告，效果如下
chatGPT 分析报告 第 1 批
| 英文题目 | 中文题目翻译 | 作者 | arxiv 公开 | 引用数量 | 中文摘要翻译 |
|---|---|---|---|---|---|
| Poaceae orthologs of rice OsSGL, DUF1645 domain-containing genes, positively regulate drought tolerance, grain length and weight in rice | 水稻 OsSGL，DUF1645-containing 基因的禾本科同源基因在提高水稻耐旱性、籽粒长度和重量方面起积极作用 | K Liu, M Li, B Zhang, X Yin, X Xia, M Wang, Y Cui | 否 | 4 | 本研究通过对 OsSGL 和具有 DUF1645(domain-specific unknown function)蛋白质域为特征的 DUF1645-containing SGL-like 序列 (SGL-like2、SGL-like6、SGL-like9 和 SGL-like10)的过表达或杂交表达，揭示了这些基因对提高水稻耐旱性、籽粒长度、籽粒重量具有积极作用。 |
| Ectopic expression of a Maize Gene ZmDUF1645 in Rice Increases Grain Length and Yield, but Reduces Drought Stress Tolerance | 玉米基因 ZmDUF1645 在水稻中异位表达可增加籽粒长度和产量，但降低了耐旱性 | Y Li, W Wang, C Hu, S Yang, C Ma, J Wu, Y Wang | 否 | 0 | 该研究显示 Maize 基因 ZmDUF1645 在水稻中的异位表达能显著增加籽粒长度和产量，但降低了水稻的耐旱性。 |
| Transcription factor OsSGL is a regulator of starch synthesis and grain quality in rice | 转录因子 OsSGL 是水稻淀粉合成和籽粒质量的调节因子 | Z Liu, S Jiang, L Jiang, W Li, Y Tang | 否 | 1 | 本研究将 OsSGL 蛋白分为 N-和 C-端，每个部分都包括 DUF1645 域。实验结果表明，OsSGL 是水稻淀粉合成和籽粒质量的关键调解因子。 |
| 水稻逆境响应蛋白 OsSGL 的生物信息学分析及原核表达条件优化 | Bioinformatics analysis and optimization of prokaryotic expression conditions of rice stress response protein OsSGL | 周炎， 樊帆， 雷东阳， 卢学丹 | 否 | 0 | 水稻 OsSGL 是 Oryza sativa 耐旱和籽粒长度基因，它参与调控水稻产量和耐旱性。该基因 CDS 总长 768 bp，编码一个包含 DUF1645 蛋白质域的蛋白质。 |
| Functional insight of nitric-oxide induced DUF genes in arabidopsis | 一氧化氮诱导 DUF 基因在拟南芥中的功能洞察 | RBS Nabi, R Tayade, QM Imran, A Hussain | 否 | 1 | 该研究阐明了一氧化氮通过蛋白后修饰(如 S-nitrosation)和…等方式调节蛋白功能的关键作用。 |
第 2 批
| 英文题目 | 中文题目翻译 | 作者 | arxiv 公开 | 引用数量 | 中文摘要翻译 |
|---|---|---|---|---|---|
| Genome-wide analysis and characterization of the proline-rich extensin-like receptor kinases (PERKs) gene family reveals their role in different developmental stages | 广泛分析和表征富脯氨酸外延素样受体激酶（PERK）基因家族，在不同发育阶段揭示其作用 | MS Kesawat, BS Kherawat, A Singh, P Dey, S Routray | 否 | 15 | 富脯氨酸外延素样受体激酶（PERK）是一个在植物中涉及多种细胞过程的受体激酶类别。然而，在核酸水平上对这些基因的了解还很有限。在本研究中，通过利用不同基因组信息，我们揭示了 14 个 PERK 基因在斑点草上的存在，并对其进行了进一步的分析。结果表明，PERKs 具有广泛的功能，参与管理斑点草发育和抗逆过程。这项研究为进一步了解这些基因的特异功能和田间应用提供了基础。 |
| Identification of Genetic Markers and Genes Putatively Involved in Determining Olive Fruit Weight | 鉴定参与橄榄果实重量确定的遗传标记和基因 | M Moret, JA Ramírez-Tejero, A Serrano | 否 | 0 | … 其中，Oleur061Scf0091g03021.1 是一个编码钙调素结合蛋白(DUF1645)的基因，已经与耐旱性相关联[25]。我们发现，其表达和果实重量正相关。这些发现揭示了在农作物育种中利用果实重量进行选择的潜在机制，同时也为改善橄榄栽培和生产提供了基础数据。 |
| Validation of Molecular Markers of Barley Net Blotch Resistance Loci on Chromosome 3H for Marker-Assisted Selection | 用于分子标记辅助选择的大麦净斑病抗性基因位点 3H 的验证 | M Kesawat, BS Kherawat, A Singh, P Dey, S Routray | 否 | 6 | … DUF1645 家族蛋白。这种蛋白最初被发现可以增强水稻和拟南芥的耐旱性[67]。随后的数据表明，编码 DUF1645 家族蛋白的基因可能与大麦净斑病抗性有关。通过本研究，我们确定了大麦净斑病抗性基因 3H 的分子标记，这为分子标记辅助选择和更高效地育种提供了基础。 |
| Sequencing and Genomic Analysis of Sorghum DNA Introgression Variant Line R21 and Recipient Rice Jin Hui 1 Revealed Repetitive Element Variation | 测序和基因组分析高粱 DNA 插入变异体系列 R21 和水稻 Jin Hui 1 受体揭示了重复元素变异 | T Zhang, X Li, Z Zhao, R Wu, Z Yang, G He | 否 | 0 | 转移远缘物种的基因组到作物是创建新种质的有效方法，但涉及到的分子机制尚不清楚。在本研究中，我们测序和分析了高粱和水稻插入系列，其中高粱水稻 R21 和 Jin Hui 1 为接收体。结果表明，高粱 DNA 插入系列在水稻基因组中引入了大量的转座子变异，提供了理解这种影响作物性状的转移方式的基础。 |
| More than the main structural genes: Regulation of resistant starch formation in rice endosperm and its potential application | 不仅限于主要结构基因：水稻胚乳中抗性淀粉的形成调控及其潜在应用 | NT Rhowell Jr, J Fettke, N Sreenivasulu | 否 | 0 | 在过去的十年中，对抗性淀粉的研究引起了广泛关注，因为它可以预防和抑制糖尿病、癌症和肥胖症等慢性人类疾病。本文综述了水稻胚乳中抗性淀粉的形成调控机制，包括改变主要结构基因的表达及其调控网络，以及转录因子和长非编码 RNA 的作用。此外，还介绍了利用代谢工程和植物生物技术改善水稻品质的潜在应用。 |
结果输出完毕时信息如下
并且在右侧可以下载提取报告
报告为 md 格式，使用记事本打开即可，如果想查看渲染效果可以使用 typora 或者 obsidian
分析完成后可以令 ChatGPT 以以上文献再写一篇文章，在输入框中输入 Write a "Related Works" section about "你搜索的研究领域" for me
比如我们课题组以生物学为主，让 ChatGPT 以刚刚的分析写一篇生物学相关的文章
图片生成
新增图片生成功能，在插件列表选择输出图片插件，填写图片分辨率，然后在输入框中输入主题，点击插件按钮即可
图片生成后复制远程链接打开图片，右键保存即可
连接谷歌获取信息
先输入问题，在函数菜单中选择联网获取信息插件，点击插件按钮搜索信息
等待一段时间后便会显示五份搜索结果并回答问题
可用功能（科研方面）
以下是官方文档列出的主要功能，部分功能可点击查看教程
| 功能 | 描述 |
|---|---|
| 一键润色 | 支持一键润色、一键查找论文语法错误 |
| 一键中英互译 | 一键中英互译 |
| 一键代码解释 | 显示代码、解释代码、生成代码、给代码加注释 |
| 自定义快捷键 | 支持自定义快捷键 |
| 模块化设计 | 支持自定义强大的函数插件，插件支持热更新 |
| 自我程序剖析 | [函数插件] 一键读懂本项目的源代码 |
| 程序剖析 | [函数插件] 一键可以剖析其他 Python/C/C++/Java/Lua/…项目树 |
| 读论文、翻译论文 | [函数插件] 一键解读 latex/pdf 论文全文并生成摘要 |
| Latex 全文翻译、润色 | [函数插件] 一键翻译或润色 latex 论文 |
| 批量注释生成 | [函数插件] 一键批量生成函数注释 |
| Markdown中英互译 | [函数插件] 看到上面 5 种语言的README了吗？ |
| chat 分析报告生成 | [函数插件] 运行后自动生成总结汇报 |
| PDF 论文全文翻译功能 | [函数插件] PDF 论文提取题目&摘要+翻译全文（多线程） |
| Arxiv 小助手 | [函数插件] 输入 arxiv 文章 url 即可一键翻译摘要+下载 PDF |
| 谷歌学术统合小助手 | [函数插件] 给定任意谷歌学术搜索页面 URL，让 gpt 帮你写 relatedworks |
| 互联网信息聚合+GPT | [函数插件] 一键让 GPT 先从互联网获取信息，再回答问题，让信息永不过时 |
| 公式/图片/表格显示 | 可以同时显示公式的tex 形式和渲染形式，支持公式、代码高亮 |
| 多线程函数插件支持 | 支持多线调用 chatgpt，一键处理海量文本或程序 |
| 启动暗色 gradio主题 | 在浏览器 url 后面添加/?__theme=dark可以切换 dark 主题 |
| 多 LLM 模型支持，API2D接口支持 | 同时被 GPT3.5、GPT4、清华 ChatGLM、复旦 MOSS同时伺候的感觉一定会很不错吧？ |
| 更多 LLM 模型接入，支持huggingface 部署 | 加入 Newbing 接口(新必应)，引入清华Jittorllms支持LLaMA，RWKV和盘古 α |
| …… | …… |
